La historia de Puerto San Julián se entrelaza con los relatos de los primeros exploradores que surcaron los mares en el siglo XVI.
Uno de los episodios más destacados fue el encuentro entre el navegante portugués Fernando de Magallanes y la tierra de la Patagonia en el año 1520.
En marzo de ese año, la expedición liderada por Magallanes ancló en la bahía de Puerto San Julián durante su viaje de circunnavegación. Fue en este lugar donde se llevó a cabo un acontecimiento histórico que marcó la exploración europea en la región.
Durante la estadía, se produjo el llamado "Motín de San Julián", donde Magallanes reprimió una revuelta en su flota, ejecutando a uno de sus capitanes y abandonando a otro. Este suceso subraya la dureza y las tensiones de las expediciones marítimas de la época.
Además de este episodio, Puerto San Julián fue testigo de otras expediciones y acontecimientos históricos. Sir Francis Drake, el corsario inglés, también pasó por estas costas en 1578, dejando su huella en la región. Durante los siglos posteriores, la localidad se convirtió en un importante punto de referencia para la navegación en la costa patagónica.
En el siglo XIX, Puerto San Julián fue un centro de actividades comerciales, vinculadas principalmente a la explotación de lana y la presencia de estancias ganaderas en la región.
Su historia, entre la exploración y la actividad económica, ha dejado una impronta única en esta localidad costera, que hoy en día atrae a visitantes por su rica herencia histórica y su belleza natural.