La historia de Las Grutas se remonta a la época prehispánica, donde las tribus de cazadores y recolectores de la región ya conocían y habitaban la zona.
Luego, en el siglo XVIII, las expediciones españolas registraron la presencia de estas grutas naturales y los nombres de algunos caciques tehuelches que las habitaban.
Durante el siglo XIX, se comenzaron a explorar las grutas con fines turísticos, pero fue recién en la década de 1960 que se inició el desarrollo urbanístico de la zona, cuando un grupo de inversores compró las tierras de la región y comenzó a construir alojamientos y servicios para el turismo.
En en alño 1972 se creó la comisión de fomento de Las Grutas, y en el año 1979 se inauguró la ruta provincial 2, que conecta la localidad con San Antonio Oeste y Viedma.
Desde entonces, Las Grutas ha experimentado un constante crecimiento turístico, convirtiéndose en uno de los destinos de playa más importantes de la Patagonia argentina.